王国纪元中的黑暗元素是贯穿前中后期的核心隐性资源，主要分为炼金所随机转化道具、联盟据点兵种黑化、日常任务进度完成、高阶材料补给、战术藏兵五大核心用途，也是零氪和微氪玩家拉开发育差距的关键资源，长期稳定囤积黑暗元素可以省去大量氪金投入，大幅加快城堡研发、装备打造和军团战力成型速度。黑暗元素全部来自地图黑暗巢穴集结击杀，巢穴等级越高，单次产出的元素品级和数量越高，品级分为低级、中级、高级、特级四个档位，不同品级的元素在炼金转化时产出道具的品质会存在明显区别，炼金所无法使用加速道具缩短转化时长，同时存在储存上限，如果单次集结获取的黑暗元素超出炼金所剩余容量，溢出的元素会直接消失，大部分成熟玩家都会设置炼金所元素过滤档位，自动舍弃低级黑暗元素，只留存中高级元素进行转化，以此提升资源利用率，避免无效囤积占用储存空间。
炼金所转化是黑暗元素最基础也是消耗量最大的用法，系统固定产出包含研发加速、建造加速、行动力、水晶、VIP点数、装备打造材料宝箱、海量基础资源、城墙修复道具、军团临时属性buff道具，其中研发加速的产出概率最高，也是前期提升发育速度最重要的物资，中期缺少猎魔装备材料、金色宝石碎片时，中高级黑暗元素转化宝箱的出货率会远高于魔物猎杀，特级黑暗元素还有概率开出高阶宝石包、领主经验卷轴和突破道具。不少玩家会集中囤积特级黑暗元素，在跨王国对战开启前批量转化，以此补足行军加速、治疗加速、护盾道具，省去大量钻石消耗，长期每日稳定参与黑暗巢穴集结，依靠黑暗元素产出的加速道具，可以做到全程不购买商城加速，稳步追上高战玩家的发育节奏。
联盟占领的Beacon据点是黑暗元素的高阶消耗渠道，据点达到二级之后，联盟管理人员可以划拨公共黑暗元素完成兵种黑化，黑化后的步兵、骑兵、弓兵、魔物部队粮食消耗会永久降低，同时获得固定的攻击、生命、防御百分比加成，据点等级越高，可黑化的兵种种类越多，五级据点能够完成全部兵种黑化，黑化加成在跨王国对战、据点争夺、集结攻城玩法中全部生效，也是顶级联盟战力碾压的核心原因。联盟公共黑暗元素需要全体成员每日刷取黑暗巢穴进行上缴，普通玩家除了上缴联盟公用元素之外，剩余的元素可以用来完成每日活跃度任务、周常联盟任务，大量任务都会要求获取指定数量黑暗元素，放弃刷黑暗巢穴会直接断掉稳定的任务奖励，长期下来会损失大量钻石和联盟币。
除了常规转化和据点黑化之外，黑暗巢穴集结本身还有隐藏战术价值，玩家可以开启长时间黑暗巢穴集结，将所有高阶兵力全部编入集结队伍当中，集结中的部队不会被敌方侦查锁定，也不会遭到进攻击杀，是低成本藏兵的最优手段，每天中午巢穴刷新之前解散集结，就可以完成兵力调度，这也是老区所有玩家通用的保兵技巧。对于后期装备成型、加速充足的玩家，多余的中低级黑暗元素不需要转化，可以留存等待节日活动，部分限时活动会开放黑暗元素兑换稀有藏品、限定头像框、永久属性加成道具，提前囤积大量元素可以在活动中兑换稀缺奖励，避免临时刷取来不及积攒资源。
